Znaczenie prognostyczne zintegrowanego profilowania genetycznego w ostrej białaczce szpikowej AD 6

Przedstawiono szacunki Kaplan-Meier dotyczące całkowitego przeżycia dla stratyfikacji ryzyka u pacjentów z AML o pośrednim ryzyku (z wartościami P dla porównania wszystkich krzywych). Wśród pacjentów z FLT3-ITD typu dzikiego (Panel A), były trzy kategorie: pacjenci ze zmutowanym TET2, ASXL1, PHF6 lub MLL-PTD, którzy mieli złe rokowanie dla całkowitego przeżycia; osoby ze zmutowanym IDH1 lub IDH2 i zmutowanym NPM1, które miały dobre rokowanie dla całkowitego przeżycia; i tych z dowolnymi innymi genotypami, którzy mieli pośrednie prognozy na przeżycie. Wśród pacjentów, którzy byli pozytywni pod względem mutacji FLT3-ITD (Panel B), były również trzy kategorie pacjentów: osoby ze zmutowanym TET2, DNMT3A lub MLL-PTD lub trisomią 8 bez zmutowanego CEBPA, które miały złe rokowanie dla całkowitego przeżycia; osoby ze zmutowanym CEBPA, które miały pośrednie prognozy na przeżycie; i tych z innymi genotypami, którzy również mieli pośrednie prognozy na przeżycie. Analiza wieloczynnikowa wykazała, że mutacje FLT3-ITD stanowiły główny predyktor wyników u pacjentów z AML o pośrednim ryzyku (skorygowany P <0,001). Continue reading „Znaczenie prognostyczne zintegrowanego profilowania genetycznego w ostrej białaczce szpikowej AD 6”

Znaczenie prognostyczne zintegrowanego profilowania genetycznego w ostrej białaczce szpikowej AD 5

Zaobserwowaliśmy, że mutacje DNMT3A i translokacje MLL wzajemnie się wykluczały (P <0,01). Determinanty molekularne całkowitego przeżycia
Analiza jednoczynnikowa ujawniła, jak wcześniej opisano, 21, 22, że mutacje wewnętrznej tandemowej duplikacji FLT3 (FLT3-ITD) i częściowe tandemowe powielenie Mll-PTD były związane ze zmniejszonym całkowitym przeżyciem (P = 0,001 dla FLT3-ITD i P = 0,009 dla MLL-PTD) (Tabela S9 w Dodatku Uzupełniającym), podczas gdy mutacje CEBPA i zmiany czynnika wiążącego rt (8; 21) i inv (16) / t (16; 16) były związane z lepszym ogólnym przeżyciem ( P = 0,05 dla CEBPA i P <0,001 dla zmian w czynniku wiążącym rdzeń) .2,23 Ponadto mutacje PHF6 i ASXL1 były związane ze zmniejszonym całkowitym przeżyciem (P = 0,006 dla PHF6 i P = 0,05 dla ASXL1) (ryc. S4 w Dodatku Uzupełniającym). Mutacje IDH2 były związane z poprawą wskaźnika całkowitego przeżycia w całej kohorcie testowej (stopa 3-letnia, 66%, P = 0,01) (ryc. Continue reading „Znaczenie prognostyczne zintegrowanego profilowania genetycznego w ostrej białaczce szpikowej AD 5”

Znaczenie prognostyczne zintegrowanego profilowania genetycznego w ostrej białaczce szpikowej AD 4

Wszystkie analizy zostały wykonane przy użyciu oprogramowania SAS, wersja 9.2 (www.sas.com) oraz pakietu statystycznego R, wersja 2.12 (www.r-project.org). Wyniki
Częstotliwość zmian genetycznych
Rycina 1. Ryc. 1. Continue reading „Znaczenie prognostyczne zintegrowanego profilowania genetycznego w ostrej białaczce szpikowej AD 4”

Znaczenie prognostyczne zintegrowanego profilowania genetycznego w ostrej białaczce szpikowej AD 3

Sekwencjonowaliśmy całe regiony kodujące TET2, ASXL1, DNMT3A, CEBPA, PHF6, WT1, TP53, EZH2, RUNX1 i PTEN oraz regiony wcześniej opisanych mutacji dla FLT3, NPM1, HRAS, KRAS, NRAS, KIT, IDH1, i IDH2. Współrzędne genomowe i sekwencje wszystkich starterów użytych w tym badaniu podano w tabeli S2 w dodatkowym dodatku. DNA parzystej remisji (tj. DNA od pacjentów, którzy mieli całkowitą remisję po indukcyjnej chemioterapii) było dostępne od 241 z 398 uczestników kohorty testowej i od 65 ze 104 w kohorcie walidacyjnej. Continue reading „Znaczenie prognostyczne zintegrowanego profilowania genetycznego w ostrej białaczce szpikowej AD 3”